関連する情報：
WSUSの完全削除を行う：
1. Download MSIZAP (http://support.microsoft.com/default.aspx?scid=kb;EN-US;290301)
2. From a command prompt, type:
For WSUS 2.0: MSIZAP T {A0D46DC6-8950-451A-8990-53C86E17666E}
For WSUS 3.0: MSIZAP T {2C0D7E35-EE6E-4DC7-BA13-2C68AEDEB59D}
3. From a command prompt, type: sc delete wsusservice
4. Again, From a command prompt, type: MSIZAP T {2C0D7E35-EE6E-4DC7-BA13-2C68AEDEB59D}
5. From a command prompt, type: aspnet_regiis -i
6. From a command prompt, type: iisreset
7. Use this KB to verify SQL is completely uninstalled (http://support.microsoft.com/default.aspx?scid=kb;EN-US;920657)
ターミナルサービスが稼働している場合は、アカウントNETWORK で動くものがあるらしい。
インストール時に「既定の Web サイト」ヘッダー名には必ずサーバー名を登録したものを用意しておく。（インストーラーに作成させるとうまくいかなかった）
あとは、
□「既定の WEB サイト」を作成し、ホストヘッダーはサーバー名。フォルダのアクセス権に SYSTEM(フルアクセス）、ASPNET(読み取りと実行、フォルダの内容一覧表示、読み取り）、IUSER_xxxx (APSNETと同じ権限） を設定し、セットアップを実行したらエラーなく終了。
再インストール前に、IISの設定でアプリケーションプールにWSUS関連があればこれも削除しておく。
DNSサーバーの設定で、CNAME(エイリアス)設定をしているを、別のホストヘッダーで接続しようとしてうまく管理ツールが動かない。
http://forums.microsoft.com/TechNet-JA/ShowPost.aspx?PostID=3086274&SiteID=36
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